根据美国猪兽医协会的最新公告,爱荷华州立大学诊断实验室提供了PEDV S1(纤突蛋白2.2kb)基因相关性和分子流行病学信息。在2014年1月24日-29日,测序了15个PEDV病例的PEDV S1序列,表明10个病例的PEDV S1序列相似,与2014年4月以后确认的PEDV毒株相似。相反,另外5个病例的PEDV S1序列与之前分离的毒株具有93.9-94.6%核苷酸相似性。但是这5个病例具有99.6-100% S1基因核苷酸相似性。
根据S1序列进化分析表明以上提到的10个PEDV病例与2013年4月之后美国鉴定的PEDV毒株具有遗传关系。PEDV序列比对表明,与美国之前发现的病例相比, 5个PEDV病例的S1序列表现基因缺失和插入。根据现有的数据,毒株似乎不可能是与美国之前鉴定的毒株变异而来的突变体。PEDV全基因组测序正在进行中,这有助于找到该病毒的起源。
Friday January 31, 2014/ AASV/ United States.
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