为了鉴别和概述与2015年3月在中国江西仔猪中爆发的严重腹泻有关的病原体,使用反转录酶-聚合酶链锁反应(RT-PCR)检测猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)。
基于RT-PCR的调查表明,在中国江西的腹泻猪中33.71%为PDCoV单一细菌感染,19.66%为PDCoV和猪流行性腹泻病毒(PEDV)混合感染。决定对典型PDCoV株-PDCoV/CHJXNI2/2015进行全基因组测序。PDCoV/CHJXNI2/2015全基因组和S蛋白序列系统发育分析表明其与香港和美国PDCoVs密切相关。
据我们所知,这是有关中国PDCoV在猪腹泻样本中鉴定,流行和全基因组测序和分子特征的首次报道。