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摘要：
家养和非家养动物，包括野生动物，为人类社会带来了巨大的经济和非经济利益；然而，疾病可以对这些动物种群的发病率、死亡率和生产力产生巨大影响，因此可以直接和间接地影响与它们相关的人类社会。本文以牲畜疾病的预防和防控为重点进行综述，强调了兽医流行病学在这方面发挥的关键作用。综述了疾病发生率的测量方法和流行病学研究中确定疾病危险因素所需的类型，重点介绍了这些方法在疾病控制措施实施中的应用。讨论了生物安全在保持畜群无病中的重要性，并概述了为实施良好的生物安全措施而采取的步骤。结论是，在制定疾病控制计划和在农场、地区和国家层面实施生物安全计划时，需要有良好的兽医流行病学知识。
一、介绍：
家养和非家养动物给人类带来了巨大的经济和非经济利益。牲畜为社区和家庭提供食物、纤维、皮毛、用作燃料和肥料的粪肥以及畜力，对社区和家庭起着重要的经济作用，并且具有文化意义，在某些社会中对个人的地位起着重要作用。宠物，尤其是狗和猫，是许多家庭的重要伙伴，有助于儿童的身体、社会和情感发展及其主人的福祉，而非驯养动物（野生动物）为人类提供了一系列好处，包括经济、健康、娱乐、科学、文化和文化，生态价值。然而，疾病会对牲畜的生产力和生产的产品质量产生重大影响、宠物的寿命和生活质量以及野生动物的生物多样性，并有可能将许多疾病病原传染给人类。此外，据估计，人类中60%的新发传染病是人畜共患病，其中70%以上来自野生动物。
随着最近对改善食品安全、粮食保障、生物多样性以及改善动物和公众健康的重视，人们越来越多地采取措施，以减少疾病在动物种群内以及从动物种群传播到人类种群的风险。控制（即将发病率和/或流行率降低到当地可接受的水平）、预防（即防止进入）和/或根除（即彻底消除）动物和人类中的疾病需要对流行病学有透彻的了解。兽医流行病学提供了调查疾病暴发、确定疾病风险因素、调查病因不明的疾病、进行疾病监测和监测、实施畜群健康计划以及制定和实施生物安全措施的工具；因此，这一学科是疾病控制、根除和预防的重要组成部分。
本文强调了兽医流行病学在家养和非家养动物疾病的控制，预防和消除疾病的作用和意义，以及如何在规模化养殖场中实施生物安全计划。
二、流行病学的关键概念：
兽医流行病学的一个关键原则是，疾病并非随机发生在某一人群中，而是更可能发生在某一人群的某些成员/群体、特定时间和特定地点；换句话说，疾病遵循特定模式。疾病控制的核心是识别这些模式和增加疾病可能性的风险因素，以及降低疾病可能性的因素，以便采取措施降低疾病的发生频率、严重程度和影响。
疾病是多因素的，直接和间接的原因、因素或属性共同作用产生疾病；为了清晰起见，这种相互关系通常以图形形式显示为因果网。提出了一系列适用于传染病和非传染病的因果关系模型。其中最简单的是流行病学三要素，这是传染病的传统模型。三位一体由外部因素（细菌、病毒、寄生虫、真菌或朊病毒）、易感宿主和环境（包括管理和饲养实践）组成，这些因素将宿主和病原体结合在一起。在这个模型中，疾病是由病原体和易感宿主在适合病原的传播途径相互作用引起的。
通过控制环境，如减少粪便污染，减少过度拥挤，或消除病原体的携带者或载体，我们可以减少疾病。同样，通过选择对疾病有抵抗力的动物，或通过自然或人工手段增加种群的抵抗力，我们可以降低疾病的严重程度，从而减少疾病的影响。相反，尽管一些宿主因素，特别是年龄和性别与许多疾病密切相关，但我们无法在人群中操纵这些因素。例如，Fentie等人观察到，雌性和较年轻的动物分别比雄性和较年长的动物更容易患绵羊和山羊痘，Zeng等人报告说，随着年龄的增长，牦牛布鲁氏菌病的发病率不断增加。这些信息在预测一个种群或一组动物的感染方面是有用的，但在疾病控制计划中很难或不可能采取行动，因为这些动物属性不能被操纵或完全从种群中提出。
与缺乏宿主特异性的病原体（如口蹄疫（FMD）和囊性包虫病）相比，只在一个或少数物种中导致疾病的病原体更易于控制、预防或根除。同样，传播方式、环境生存特性以及储藏宿主、载体和媒介的存在都会影响疾病控制的分布和采取的措施。野生动物的存在在某些疾病向人类和其他动物的传播中扮演着重要的角色，它们是lyssa和Henipah病毒和钩端螺旋体病等病原体的携带者，或者是棘球绦虫等寄生虫的宿主。媒介对某些病原和疾病的传播起着关键作用，如蓝舌病，已经受到全球变暖影响下媒介分布增加的影响。病原体（如肉毒梭菌和炭疽杆菌）在环境中的长期存活对这些特定疾病的分布和延续至关重要，也有助于预测疾病的发生。
尽管疾病的病原体、宿主和环境特征在预测疾病的位置和发生方面是有用的，但为了评估疾病控制或预防计划的影响或成功，必须测量疾病的发生频率。
三、疾病频率：
流行病学中使用的两种疾病发生频率的测量方法是流行率和发病率，这些参数的变化是疾病控制计划的关键结果。
流行率是一种疾病的静态测量，通常报告为受病原体感染/呈阳性的个体比例，或血清学检测呈阳性的个体比例。该指标通常以百分比形式报告，并应包括95%置信区间（CI），以提供抽样总人群中疾病频率的估计值，并用于比较研究结果。在中国西藏自治区三个县的一项牦牛布鲁氏菌病研究中，Zeng等人报告了使用虎红平板凝集试验（RBT）和竞争性免疫酶试验（C-ELISA）平行解释的牦牛个体流行率为2.8%（95% CI：2.0–3.7）和18.2%（95% CI：12.9–24.6）。然而，测试流行率受所用测试的敏感性和特异性的影响；因此，许多研究使用公式真流行率=（测试流行率+特异性-1）÷（敏感性+特异性-1）调整诊断测试的这些特征的测试流行率。例如，调整试验不确定度后，Dukpa等人报道了来自不丹的牛中FMD的真实动物水平流行率为17.6（95%可信区间：15.6–19.5）。当使用不同的诊断测试时，估计疾病的真实流行率可以比较不同地点的控制措施，并且在试图证明群体的无疫状态时非常重要。
流行率是衡量一种疾病或抗体的当前频率，是一种静态指标，而发病率则是衡量疾病传播的动态指标。发病率通常报告为发病风险（累积发病率）或发病率（发病密度）。例如，Bran等人的研究报告，在四个月的时间里，奶牛跛足的累计发病率（在一段时间内发生新病例的风险发生率）为29.6%（表明近三分之一的被研究奶牛在研究期间出现跛足）。他们的研究强调了跛足的特定危险因素的重要性，动物的身体状况得分较低，胎次较高，蹄上的病变更容易发展成跛足。
与发病风险相反，发病率是一个群体中新发病病例的数量除以处于危险中的动物时间单位的总数。在一项研究中，Watters等人报告了奶牛和牛群中体细胞计数（eSCC）升高的风险因素，所有研究牛群的风险为每头奶牛每年0.91 eSCC。这些动态测量表明动物在特定时期内感染疾病的风险或可能性。
疾病的流行率和发病率可以通过疾病术语、疾病记录和诊断技术的改变来改变，也可以通过疾病的真实传播导致疾病频率的改变，或者通过成功实施疾病控制计划导致疾病控制的改变来改变。一个成功的疾病控制计划应该通过控制特定疾病的风险因素来降低疾病的流行率和发病率。
四、疾病危险因素识别：
确定增加疾病风险的因素或降低疾病风险的因素（保护性因素）很重要，这样就可以采取可能的措施来减少疾病或防止其进入。
疾病的风险或保护因素可以是群体统计学、畜牧业/管理、环境或社会经济因素，并通过进行描述性流行病学研究（横断面、病例对照或队列研究）进行评估。假定的危险因素与疾病之间的关联强度通常使用计算出的优势比（OR）及其95%的置信区间来评估。
4.1. 横断面研究
横断面研究通常用于评估疾病的流行率或血清流行率，并确定该疾病的危险因素；然而，它们对罕见疾病的使用较少，并且可能受到混淆。Miyama等人报告，在日本南部109个奶牛群的横断面中，受试牛群的钩端螺旋体病流行率为65%。在这项研究中，他们确定了较大的畜群和包含从北海道引进的动物的畜群是血清阳性的危险因素。然而，他们的发现突出了疾病控制方面的一些挑战，因为与较小的畜群相比，较大的畜群提供了经济效益和规模经济。类似地，在澳大利亚对猪的食道-胃溃疡（OGU）进行的一项大型研究中，Robertson等人报告说，OGU水平高的猪群的大多数风险因素（即随意喂食：OR 13.7；使用自动喂食系统：OR 7.8；而喂食颗粒日粮（OR384）并不能有效地控制成本，因为它们与减少饲料消耗、提高生长速度和降低劳动力成本有关。相比之下，其他与OGU流行率较高相关的因素（即，使用来自大坝而不是地下钻孔的水：OR 3.8；肥育猪日粮配方的变化：OR 1.5）易于操作。
同样，在一项关于狗肥胖的研究中发现，超重的狗有更高的几率被阉割（OR2.8），被喂食零食（OR1.5），被喂食一天一次（OR1.4），和生活在一个单一的狗窝的（OR1.6）。相反，每周锻炼一小时，肥胖的几率降低（OR0.9），也就是说，锻炼对降低肥胖的风险有保护作用。根据这些发现，建议主人停止提供零食，将当前的食物分成两半，在一天中的两个不同时间喂食，并增加狗的运动量。
4.2. 病例对照研究
病例对照研究非常适合于罕见疾病，包括选择病例（患病动物/农场/畜群）和随机选择或与对照（非患病动物/农场/畜群）匹配。蒋等在我国鄱阳湖地区进行了家禽传染病病例对照研究，根据家禽死亡史确定病例和对照。在这项研究中，他们表明，采用疫苗接种计划是一个保护因素，降低了发病的可能性（OR0.4），而与其他后院禽群的接触增加了禽群死亡的风险（OR1.72），农民家周围20米范围内的家禽饲养密度也增加了（OR1.08）。
怀特等人采用病例对照研究，以确定澳大利亚肉牛群中未知来源的先天性软骨营养不良的危险因素。这项研究强调使用流行病学方法调查病因不明疾病的危险因素，包括牧场类型、地形和土壤钾水平对疾病存在的影响。这些发现为母亲营养失调与疾病之间的关系提供了证据。
Toyomakia等人同样采用病例对照的方法，在日本流行的早期阶段确定猪流行性腹泻（PED）的危险因素。他们发现，在过去五年内发生的猪繁殖和呼吸综合征（OR1.97），对屠体和废物使用普通堆肥站（OR2.51），以及使用猪粪便处理服务（OR2.64）增加了患PED的可能性。这些发现强调了管理因素加上并发疾病对PED的影响，正如许多其他疾病的报道一样。
Puerto Parada等人进行了一项回顾性病例对照研究，以评估所选风险因素与奶牛群感染鸟分枝杆菌亚种之间的关系。副结核（MAP）。畜群规模（OR 1.17）和过去五年每年购买的奶牛占总畜群规模的比例（OR 5.44）与正MAP畜群状态显著相关。后一项发现强调了通过引入动物将MAP引入无MAP畜群的风险，这也是许多其他传染病的风险。
4.3. 队列研究
队列研究尽管实施成本高、耗时长且不适用于罕见疾病，但提供数据以计算发病率和一般情况下尽量减少混杂结果的优势。在Pires等人的一项研究中，对900头猪进行了8次重复取样的纵向队列研究，以评估动物的沙门氏菌脱落。冷暴露（温度低于动物的热中性区）和暴露于温度-湿度指数（THI）>72都与沙门氏菌的脱落呈正相关。研究人员得出的结论是，他们的数据表明，猪的热环境是沙门氏菌病致病途径的一个组成部分，减少猪暴露于次优的热参数应减少猪的沙门氏菌；这一结论强调了环境在这种疾病中的作用。
同样，Pinchbeck等人进行了一项为期两年的前瞻性队列研究，并测量了英国一组马的受伤率（每1000次发生28.8次）。他们发现受伤的危险因素与比赛的速度和马脚的形状有关。这些发现再次强调，并非所有的疾病风险因素都可以被调控。开展与上述研究类似的流行病学研究的关键成果是确定疾病的危险因素。对这些风险因素的了解有助于制定控制疾病的建议，这些知识随后被纳入为相关牲畜物种制定的生物安全计划中。
五、生物安全：
在21世纪和20世纪末，人们从治疗个体转向了疾病预防，这使得人们越来越重视实施生物安全。为了使一个农场、地区或国家免于疾病，生物安全至关重要。生物安全被描述为管理病虫害进入、出现、建立或传播的风险，并对动物、植物、人类健康、经济、环境或社区造成危害。尽管这一概念在国家和国际层面上起作用，但大多数兽医都参与评估和预防疾病在其护理下的个体养殖企业中的传播。农场级生物安全的一个关键组成部分是生物防护或内部生物安全，它被描述为防止传染源在农场动物群之间传播的一系列管理实践或旨在防止传染源离开农场的管理实践。
为了促进企业内部采用和强调生物安全和生物防护的关键概念，开发了一系列首字母缩略词，包括隔离、抵抗和卫生（IRS）和卫生、交通控制、评估、隔离、抵抗和安全（STAIRS）。教育、培训和所有利益相关者的参与对于企业、区域和国家层面的生物安全的成功至关重要；这些利益相关者包括养殖企业、行业机构和城乡社区的所有者、管理者和工人。在国家和国际层面上有许多关于生物安全的文章和网站。本节着重于在农场或企业层面实施生物安全。
畜牧企业生物安全计划的制定和实施需要有文件记录的方法，并且已经开发了评分系统来对生物安全协议及其实施进行排名。
Carr和Howells[17]总结了家禽和生猪企业的生物安全要求，并强调引进同种动物是引进疾病的最高危险。Fèvre等人同样强调了动物贸易在将病原体引入以前没有疾病的畜群/地区方面的重要性，而Siengsanan-Lamont等人证明了泰国家禽群中通过引入鸟类而增加的禽流感风险，Dukpa等人报告，在出现多个畜群混合的公共放牧畜群中，FMD的风险增加，La等人和Phillips等人表明，通过引入活猪，将猪肠球菌引入猪场的危险。如果将活动物引入一个单位，则引入的动物应与原群体隔离至少一个月，在此期间，可以评估其健康状况，并且新动物可以暴露在其新位置的生物群落中。
通过引入活的动物而进入疾病的危险导致了一项建议，即密集型畜牧业应保持为封闭的畜群/羊群/单位。然而，维持一个封闭的群体系统的挑战之一是以安全的方式引入新的优势基因。尽管这传统上是通过使用进口精液或胚胎来实现的，但这种方法仍然存在引入疾病的风险；例如，de Smit等人报告说，在没有任何临床疾病证据的情况下，公猪精液中存在猪瘟病毒。
家畜与邻近或同一物种的野生动物接触也被确定为疾病进入的风险。在野生动物的情况下，可以通过栅栏和种群控制将这种风险降至最低。安全的围栏，特别是对于密集型畜牧业，以尽量减少其他动物、人和车辆的进入被认为是必不可少的。
在大量的研究中，除了饲养的物种外，包括驯养动物和野生动物在引入一系列疾病中的作用已经被报道。La等人报告了在家养狗、啮齿动物和鸟类中检测到猪肠球菌短螺旋体的情况，并提出这些动物可以将病原体或新菌株引入猪场。在检测到小鼠、大鼠、苍蝇和狐狸中的沙门氏菌菌株与蛋鸡中的相似时，Liebana等人提出这些动物和载体可以在家禽企业之间引入和传播这种细菌。多位作者也强调了野生鸟类作为禽流感病毒携带者的可能性，并建议尽量减少牲畜与所有野生或野生动物之间的接触。同样，应实施媒介控制，特别是鸟类、啮齿动物、苍蝇和其他可能将病原体转移到家畜的昆虫。
访问畜牧企业的人员，包括兽医、畜牧顾问、授精师、蹄修剪师和饲料供应商，也是疾病传入单位的潜在风险。为了降低这种风险，只有必要的访客才允许参观动物居住的区域/建筑物，企业应向这些访客提供防护服和鞋。应为所有工人和访客提供此类防护服和防护鞋，不得在任何其他单位或企业外穿着。同样，应要求来访者和工人在企业内外淋浴，以减少疾病传入和传出的风险。
死亡的动物应该通过燃烧、掩埋或堆肥的方式移除和处理，以减少病原体的存活，并避免食腐动物进入。粪便和用过的垃圾/床上用品也应进行堆肥和处理，以防止其他动物进入。
猪接触（即食用）未煮熟的肉或食品（即泔水）的危险性已被强调用于几种大流行疾病，包括非洲猪瘟、猪瘟和口蹄疫。因此，许多国家禁止泔水喂养，以尽量减少这些疾病的风险。
受污染的饲料和水可导致疾病的传入，如猫弓形虫囊的污染引起的弓形虫病，摄入受棘球蚴虫卵污染的牧草对小型反刍动物的感染很重要。确保饲料棚和水源免受害虫和其他动物的侵害是减少这些风险的关键。
只有必要的车辆才能进入畜牧企业，可以通过设置围栏尽量减少这些车辆的进入。建造基础设施，使饲料能够从外部输送到内部，然后通过螺旋输送器运到储料仓/筒仓和巷道中，用于将动物从建筑物引向外围围栏外，有助于降低潜在污染饲料卡车和牲畜运输带来的疾病进入风险车辆。需要进入设施的车辆只能通过一个单点通过设施进出，以清洗和消毒车轮，最好是整个车辆。
将被粪便和其他动物产品（如毛发、羽毛、唾液）污染的设备引入农场也是一种潜在的疾病引入风险，许多研究强调了通过进入受污染设备和粪便引入疾病的风险，如新城疫。
应劝阻或阻止畜牧企业的工人在其他畜牧企业工作或饲养类似的牲畜。此外，还应劝阻员工参观其他牲畜饲养单位、动物市场、动物展览和屠宰场，如果他们参观了，则在此类活动后至少三天内不得与雇佣企业的动物接触。
畜牧企业的密度、邻近同一物种单位的距离、屠宰场和主要运输路线的距离也被认为会影响疾病传入牛群/羊群的风险。
传统的密集型产业能够比小规模或粗放型产业更有效地实施生物安全；然而，Compo等人强调，尽管许多农民了解生物安全实践，但许多农民未能采用为其企业推荐的协议。一些作者还强调了业余爱好或小型企业的生物安全水平较低，与大型商业企业相比，这些企业更可能对生物安全的需求缺乏了解，对动物的限制较差，基础设施较差。其他人强调了教育在确保畜牧业采用生物安全措施以降低疾病进入风险方面的重要作用，以便使这些行业实现最大生产力。
疾病控制和预防需要采取多方面的方法，全面了解企业目前的疾病状况、可能的疾病威胁以及如何将引入的风险降至最低。这种方法需要对兽医流行病学的学科有很好的了解，了解疾病的传播和分布、疾病的危险因素和预防疾病的方法。
结论是，生物安全对于确保企业、地区和国家内牲畜的健康和生产力至关重要，兽医流行病学知识对于制定健全的生物安全措施至关重要。
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来源： 李曼养猪大会 原文链接： https://mp.weixin.qq.com/s/g6Izn3tW_9uCb_enhu7y0g
