可用分析
聚合酶链反应(PCR)
- 检测病毒核酸(RNA)特定序列的存在。
- 样本类型:组织,全血,血清,口腔液体等。
- 优点:
- 使用单独的引物同时检测同一样品中的PRRS 1型(欧洲)和2型(北美)。
- 灵敏度高(可以检测到少量病毒)。
- 早期发现-急性病例应为阳性。
- 可以使用许多不同的样本类型(组织,血液,血清,口腔液体等)。
- 成本适中:
- 通常可以同时检测5个血清或组织样本以降低成本,同时最大程度地降低灵敏度损失。
- 由于预期的较高Ct值(较低的病毒浓度),通常不合并口腔液体,这可能会导致敏感性显着下降。
- 缺点:
- 实验室必须定期更新引物以避免假阴性。
- PRRS 1型和2型引物都必须更新。
- 测序需要区分疫苗病毒和野生型感染。
- 实验室必须定期更新引物以避免假阴性。
酶联免疫吸附测定(ELISA)
- 检测抗体的存在。
- 样品类型:血清或口腔液体(某些试剂盒)。
- 优点:
- 大多数可检测PRRS 1型和2型抗体。
- 动物保持阳性数月(3-12个月)。
- 可用于慢性病例。
- 缺点:
- 各种可用的商品试剂盒之间,检测到的特异性抗体和检测时间可能略有不同。
- 动物血清阳性需要7到10天。
- 无法区分母源抗体与暴露。
- 无法区分疫苗与野生型感染。
免疫组织化学(IHC)
- 检测病毒抗原的存在。
- 样本类型:组织。
- 优点 :
- 病变部位检测病毒(良好的病因证明)。
- 可以识别病毒的低、中、高含量。
- 缺点 :
- 必须提交正确的组织样本。
- 与PCR相比,需要更多的病毒存在。
- 仅可评估少量的组织样本。
基因测序
- 测序病毒的核酸基因(RNA)。
- 测序病毒的核酸基因(RNA)。
- 优点:
- 可以区分野生型病毒和疫苗。
- 可以帮助区分新病毒的引入与现有或过去的病毒。
- 缺点:
- 昂贵。
- 通常仅对ORF5进行测序,其仅为约15,000个碱基对中的600个。
- CT值大于34的样本往往难以测序。
表1:爱荷华州立大学兽医诊断实验室基于口腔液体样品中PRRS PCR循环阈值(Ct)值的序列成功率。Chris Rademacher等人,2016
样本 | PCR Ct范围 |
测试总样本数 | 测序样本数 |
测序阳性样本比例 |
---|---|---|---|---|
所有样本 | <30 | 2016 | 2013 | 99.85 |
30.00-31.99 | 389 | 361 | 92.80 | |
32.00-33.99 | 324 | 265 | 81.79 | |
34.00-35.99 | 185 | 109 | 58.92 | |
36.00-37.00 | 65 | 26 | 40.00 |
间接荧光抗体(IFA)
- 检测抗体的存在。
- 样品类型:血清。
- 优点:
- 与PCR测试一起,可以用作意外ELISA阳性样品的确认测试。
- 与PCR测试一起,可以用作意外ELISA阳性样品的确认测试。
- 缺点:
- 对于大量样品不可行。
- 用于分析的病毒分离物对结果的影响。
- 可靠性高度依赖于技术人员的技能。
结果解释
PCR
- 阳性-病毒存在/传播高度提示病因,尤其是Ct值较低且存在临床症状。最近用改良活病毒接种疫苗可导致PCR阳性。
- 阴性-如果在感染后期进行检测,则可能会呈阴性或未检测到病毒。
ELISA
- 阳性-母源抗体或过去接触疫苗或野生型病毒(通常在接触后7-10天以上)。
- 阴性-阴性或感染初期以至于无法检测到(通常必须在暴露后至少7-10天)。
IHC
- 阳性–病变部位存在病毒。
- 阴性-如果在感染后期进行检测,则可能会呈阴性或未检测到病毒。
基因测序
- 疫苗病毒–预期同源性>99%。
- 野生型病毒-估计每年约有1-2%的同源性损失。
IFA
- 阳性-母源抗体或过去接触疫苗或野生型病毒(通常在接触后7-10天以上)。
- 阴性-阴性或感染初期以至于无法检测到(通常必须在暴露后至少7-10天)。
场景
母猪/后备母猪流产
- 流产的胚胎:收集6-8个胚胎合并进行PCR测试。流产的胚胎中只有大约50%的PCR阳性(因此需要对许多胚胎进行采样),但是阳性胚胎中病毒的浓度很高,因此可以每10个一组进行PCR检测。
- 流产的母猪/后备母猪:收集最近流产(<10天)的母猪/后备母猪的血清以进行PCR测试。可以每5组一起进行测试。ELISA测试没有用,因为母猪/后备母猪通常需要7到9天才能检测出阳性。
母猪/后备母猪繁殖问题
- 从受影响的母猪/后备母猪收集15至20个样品,从未受影响的母猪/后备母猪收集15至20个样品,并通过PCR(5个或6个一组)和ELISA(单独)进行测试。
分娩时的弱小仔猪
- 可以从有较弱仔猪的窝中收集群体口腔液体,并通过PCR进行测试。
- 可以在产房从不同窝的猪中收集睾丸(如果进行阉割),尾巴,舌头组织(死猪)。可以将大量样本集中在一起进行测试。
- 通过每窝收集2至3头仔猪,收集10窝受影响仔猪的血清样品,并通过PCR进行测试,每组5-6头仔猪。确保仔猪未进行PRRS疫苗接种。
具有PRRS急性临床体征的生长猪
- 从4到6个不同猪栏中收集口腔液体,并通过PCR分别进行测试。不要合并样本进行测试。
- 从4到6个不同猪栏中收集口腔液体,并通过PCR分别进行测试。不要合并样本进行测试。
具有PRRS慢性临床体征的生长猪
- 从4到6个不同猪栏中收集口腔液体,并通过PCR分别进行测试。不要合并样本进行测试。也可以通过ELISA测试口腔液体样品。
- 从具有临床体征的猪中或随机取样,采集30份血清样品,并通过PCR进行测试。可以以5个或6个为一组进行PCR测试。还可以通过ELISA测试单个样品以确认暴露。
来源:Pig333