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毫无疑问，粪便管理是许多猪场的一大难题。在过去的30年里，粪便管理水平有了显著的改善，但仍有许多地方需要改进。由于营养、遗传学和动物管理方面的极大改善，目前已经实现了30年前难以想象的饲料转化率，但对采食高含氮饲料所产生的粪便的处理方法并没有太大改变。我们需要采用一种将嘌呤作为资源的技术，将问题转化为机遇。
综合管理的基础包括从源头（动物饲料）、建筑物的设计和管理方面采取行动，例如自动和每日清除粪便，以避免污染气体的排放，并对其储存和最终处理，及其在农业领域的使用进行规划。在综合管理的措施中，必须准确界定问题，以便找到适当的解决办法，尽量减少对环境、大气、土壤和水的影响。
养分管理计划旨在使粪浆中的养分含量在空间和时间上与作物的需求量相匹配。管理计划必须至少考虑以下三个方面：
- 减少可能限制其后续使用的成份，如过高的水、氮、磷或重金属含量，这需要评估当前猪场的管理技术，并使用新的日粮
- 土壤和作物施肥计划。施肥计划必须基于对土壤、作物需求的了解——考虑到施用率和季节，以及气候和水文特征。
- 必须实施的策略。该策略应该是一个综合措施，其目的是改善粪便特性，以满足其作为优质肥料的需求
管理计划还必须包括储粪池的计算，储粪池的体积必须能储存足够量的粪便——因粪便是持续产生的，但施肥不是连续进行的。管理计划应被视为一个项目、一个行动计划或一个战略规划，作为猪场管理方案的一部分。
改变日粮以生产氮磷含量较低的粪浆，可以降低管理成本，并减少对农田面积的需求。最大限度地减少水的使用可导致粪浆的流速减慢，从而降低储存量，并降低运输成本。猪场可与农作物种植户合作共同管理有机肥的使用，并优化运输和物流。
粪便处理方案适宜性取决于地理区域、管理程序、最终产品的期望质量以及相关的经济成本。可能有许多具体目标，但基本目标必须是提高管理能力，即决策能力。
从技术上讲，在粪浆处理领域几乎可以做任何事情，但是仅仅用处理技术来解决这个问题是错误的。用储存了几个月的粪浆生产沼气可能会适得其反，因为在该段时间里，粪浆已释放出沼气、氨和挥发性有机化合物，而动物们一直在吸入这些气体。对于长期储存的粪浆，分离系统的效率也较低。
很明显，猪场必须在复杂多变的环境中做出决定，这种情况与其他类似猪场的情况不同。了解处理技术是很重要的，但更重要的是拥有做出决定的工具，确定问题的类型或严重程度，以及确定适当解决方案的标准。通常不需要复杂的技术，而是改变习惯，重新设计猪场的某些方面，或与其他养殖场或种植户合作。
