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疾病诊断包含一系列步骤，这是诊断可靠的原因。这样讲似乎没有意义，但是我们生活在实验室诊断的年代。这意味着什么？我们经常将实验室诊断结果作为诊断的基本甚至要素。毫无疑问这是一个错误，让我们陷入迷惑。
让我们做一些排序的事情。常识告诉我们当诊断PCV2相关疾病或者其它疾病时，我们必须进行系统诊断。当然，我们必须遵循一些步骤（见图1），避免忽略其中任何一个。我们必须始于临床诊断，全面检查动物，寻找帮助我们诊断的症状。发生系统性圆环疾病时，症状很常见（体况下降、皮毛粗糙、腹泻、呼吸困难、黄疸），但是我们不能忘记PCV2在呼吸系统综合征和繁殖障碍疾病（造成死胎、木乃伊胎、弱仔）发挥也一定作用，但是这些症状都不特异。当然，在这个阶段，我们必须了解病史，考虑到猪群的病史。
图1. 诊断过程基本图
第二部就是病变大体诊断，根据临床剖检结果。
不幸的是，猪群疾病过程有一定死亡率。一头死猪是收益的损失，我们可以通过获得资产最小化，致死性疾病信息。PCV2案例中（临床疾病是断奶仔猪多系统衰竭综合征），我们可以看到淋巴结肿大（尤其是浅表腹股沟和肠系膜淋巴结）、间质性肺水肿（表明间质性肺炎）、猪皮炎肾病综合征症状，记住这个病毒能够导致繁殖障碍，我们可以看到死胎、弱仔、木乃伊胎，为了看到可见的心脏疾病，我们可以做一个剖检。剖检是死猪发挥价值的唯一方法。
这两步给我们一个初步诊断，实施治疗。但是在其它情况，这需要确诊。不幸的是，PCV2相关疾病不在导致特异临床或者大体病变之列。依赖于实验室检测的时代来到了。
我们将会使用临床检查或剖检的样品（记住动物死亡距离剖检的时间，因为有时安乐死动物是值得的）。在所有的实验室技术当中，最常见的诊断手段毫无疑问就是组织病理学（包括免疫细胞化学）、血清学（包括区分IgG 和 IgM，我们推断疾病是处于初期还是末期）（见图2）、分子手段包括PCR(经典PCR和实时PCR，允许我们定量PCV2 拷贝数）、原位杂交。
图2. PCV2血清学检测分析IgM 和 IgG 水平，帮助我们推论感染时刻。q-PCR 用于分析病毒载量。
所有这些都有优势和劣势。当然，组织病理学将会帮助我们决定微观PCV2淋巴组织特征性病变（淋巴细胞耗竭和肉芽肿性炎症）、肺脏（间质性炎症）、肠道（肉芽肿肠炎）、甚至胎儿的心脏（纤维和/或坏死性心肌炎）。免疫细胞化学和原位杂交可以帮助我们确定病毒和不同组织的病变的联系。PCR帮助我们确定病毒的存在，病毒血症或者病毒量（如果是胎儿，107PCV2 拷贝数/500 ng 提取DNA表明感染PCV2），但是不允许我们确定病毒与特征性病变相联系（Sorden标准之一，临床症状和组织病变，为了诊断出PMWS）。此外，血清学实验阳性反应曾经与病毒接触过（采样时感染或者采样之前感染），但是给我们的信息仅限于此。血清学的另一个应用是评估免疫效果，但是如果仅仅基于血清学结果，会带来很多混淆。因为免疫后，血清学阴性不代表动物不受保护。可以用来检测死胎腹膜腔PCV2 特异性IgG，虽然不确定这个症状是否与子宫内感染PCV2有关。
一旦我们获得实验室结果，我们将会综合分析得出一个初步诊断，我们能够获得确诊结果（因为不能做出结论，所以以上提到测试结果）。
我们必须记住跳过这个诊断图中的任何一步都会导致犯错误的风险。如果出于效果或者经济原因，试图通过PCR或者血清学诊断，而不对动物进行剖检，甚至不用温度计，这是我们无论如何要避免的，实验室检测会花费一些钱，对死亡动物进行剖检，可以部分挽回动物死亡造成的损失。
