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PCV2可导致断奶后多系统衰竭综合征（PWMS）和其他PCV2相关疾病。在猪场和实验室水平上已被证实PCV2是潜在的胎儿病原体。PCV2可在母体病毒血症时通过胎盘传播到胚胎/胎儿，或者通过人工受精感染的精液传播给胚胎/胎儿。这取决于妊娠的阶段。胚胎感染会造成胚胎死亡和母猪返情（有规律/无规律）。胎儿在妊娠前70天感染可导致死胎和木乃伊胎。心脏是主要的靶器官，大量的病毒在心肌细胞内复制导致心脏病变和功能障碍（心力衰竭）。
妊娠70天后的胎儿有可能形成免疫应答，PCV2感染的结果取决于病毒的复制和免疫力的强弱。胎儿可能死亡，可能存活但体质较弱，也有可能存活且没有负面影响。总体而言，PCV2不会导致流产，但会导致感染胎儿发生：木乃伊胎，死胎和体质弱的仔猪。根据这些特征，PCV2被归类为SMEDI病毒（Stillbirth 死胎，Mummification 木乃伊胎，Embryonic Death 胚胎死亡和Infertility 不孕）。PCV2a 和PCV2b菌株在内部胎儿感染上表现相似。由于该病毒复制周期特别长（36小时），因此，病毒感染后需要一定的时间使胎儿致死并在子宫内传播。
血清阳性率研究表明，在全球范围内，PCV2在猪群中广泛传播，且在猪只失去母源免疫力后呈现出系统性感染。因大部分后备母猪在很小时就感染此病毒，它们通常在第一次人工受精时获得免疫力。因此很难找到PCV2阴性的后备母猪。因此，如同其他几个研究小组的结果，PCV2相关的繁殖障碍发生率很低。然而，随着猪群健康状况的改善，阴性后备母猪的比例在增加。这些易受感染的后备母猪和它们的胚胎/胎儿存在感染PCV2的风险，并可导致相关的繁殖障碍。本文建议在将后备母猪转入母猪群前的隔离期对后备母猪进行检查。
可通过检测心脏内PCV2（病毒分离/定量聚合酶链反应）或PCV2感染细胞（免疫染色）来诊断由于PCV2子宫内感染而造成的繁殖障碍，心脏是PCV2在胎儿感染的靶器官。由于大量的PCV2遗传物质广泛存在于环境中，采集样本进行定量聚合酶链反应试验以确定PCV2存在时，应倍加小心。通过测量胎儿体液中PCV2抗体来进行诊断时，由于少量的抗体可能通过胎盘渗透到胎儿，应倍加小心，特别是当有繁殖障碍时。
通过免疫接种母猪来预防PCV2通过胎盘传播的理论尚未得到证明。然而通过疫苗接种可很好的控制病毒血症，这种理论仍被接受。本文建议对血清学阴性的后备母猪进行免疫接种。免疫接种/再次免疫接种可使母猪的免疫状况均质化，这可改善母乳的免疫力。PCV2感染时可提升仔猪的母源免疫力，其他病原体的感染可减弱母源免疫力。缺乏与PCV2混合感染的病原体可提高保育猪的临床情况。在保育猪，通过采取全进全出措施，有效的清洁/消毒措施，以及使用抗生素，可减少混合感染病原体，从而进一步减少PCV2导致的相关问题
