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在欧洲和美国，人和生产动物的艰难梭菌核糖体基因型078存在重叠现象，该基因型也是全球范围内艰难梭菌的主导基因型。尽管在澳大利亚有很多特发性肠炎的案例报道，但至今澳大利亚仔猪艰难梭菌的感染情况还未展开过系统调查。澳大利亚仔猪艰难梭菌的菌株有可能与世界其他地方的分离株不同，这是由于澳大利亚地理隔离、严格的进口家畜检疫法规、低人口密度和猪饲养密度所致。
我们研究了腹泻新生仔猪的艰难梭菌流行率，利用多重分离方法分析了艰难梭菌的新菌株。
2009年7月到9月，采集了三个腹泻猪场185头新生仔猪的直肠拭子。三个猪场分别位于西澳大利亚两个不同的地点（20km之隔），属于一自繁自养公司。三个猪场50%-80%的仔猪都患有腹泻，死亡率为11%-14%。患病仔猪表现出发病早、非出血性、黄色、面糊至水样腹泻的症状。未治疗的仔猪表现的病程为饲料利用率低、厌食、脱水、死亡。健康仔猪在1-3日龄时给予阿莫西林或青霉素预防性治疗。
185头仔猪中， 114头分离出艰难梭菌，分离率为62%：131头患有严重腹泻的仔猪中70头分离出艰难梭菌（50%），43头患有不同程度的腹泻仔猪中有33头分离出艰难梭菌（77%），11头无症状仔猪全部分离出艰难梭菌（100%）。所有分离株全为克隆株，所有菌株均为核糖体基因型237，毒素谱为tcdA-tcdB+cdtA+tcdB+。
我们的结果表明澳大利亚仔猪腹泻的艰难梭菌的菌株的核糖体基因型与世界其他地域分离株不同，为核糖体基因型237。我们发现的分离株包含独特的毒力基因区域，使小鼠体重减轻的程度高于核糖体基因型078。鉴定这一分离株是诊断和应对澳大利亚仔猪新发病的第一步。未来的研究将侧重于流行率、实验室检测、流行病学调查，这对于理解猪的疾病传播周期、人和动物疾病关系有重大意义。
Michele M. Squire, Glen P. Carter, Kate E. Mackin, Anjana Chakravorty, Torbjörn Norén, Briony Elliott, Dena Lyras, and Thomas V. Riley. Novel Molecular Type of Clostridium difficile in Neonatal Pigs, Western Australia. Emerging Infectious Diseases. 2013. Volume 19, Number 5—May 2013