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据系统进化学预测，经典猪瘟病毒（CSFV）是由两个分支组成。减毒活疫苗，像猪瘟兔化弱毒疫苗（HCLV）,已经广泛被用于保护猪免受CSFV感染，但是关于接种疫苗对CSFV进化的影响还没有研究。
我们通过比较疫苗相关和非疫苗相关CSFV株，对接种疫苗影响CSFV进化做了一个系统分析。我们发现：接种疫苗可能会引起病毒基因重组和点突变，从而对病毒株多样性和免疫逃逸产生影响。我们还发现：接种疫苗可能影响CSFV的毒株活力、进化速度、适应性进化。我们的证据表明：接种免疫也可能通过影响猪病毒密码子编码，从而改变宿主的适应性。这些发现表明避免过度使用CSFV减毒疫苗很有必要。
Ji W, Niu DD, Si HL, Ding NZ, He CQ. Vaccination influences the evolution of classical swine fever virus. Infect Genet Evol. 2014 Apr 18;25C:69-77. doi: 10.1016/j.meegid.2014.04.008.