一项协作研究发现了猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)的一个新基因的表达机制。PRRS病毒是一个重要的猪病原体,每年它会使美国养猪业损失6亿多。这项发现为科学家探索该病的防控措施提供一个新的途径。
堪萨斯州立大学诊断医学和病理学副教授方莹博士主持了这项研究,寻找PRRS病毒独特的基因表达机制。她和她的同事发现病毒可以通过特有的核糖体移码信号产生一种新的蛋白,即nsp2TF。
方莹和她欧洲搭档共同做了这项研究,包括荷兰莱顿大学的Eric Snijder及他的团队成员、剑桥大学的Andrew Firth, Ian Brierley 及Brierley的实验室成员。方莹的病理学博士生李燕华(中国人)为本研究做了重要贡献。方莹之前的博士生孙志和朱龙超(在方莹的诊断医学和病理学实验室作为访问学者)也参与了本研究。
程序化负一核糖体移码(−1 PRF)是一个应用广泛的翻译机制,它能促进单链mRNA翻译成两条多肽链。通常,核糖体与mRNA二级结构的交互作用会促进聚合物光滑序列的−1移码。现在,我们要讲的是不常见的−2移码(−2 PRF)信号,它能指导PRRSV跨读框蛋白[无结构蛋白 2TF (nsp2TF)]高效表达。值得注意的是:这个动脉炎病毒PRF信号缺乏一个明显的刺激RNA的二级结构,但是可以肯定的是,它也会使−1 PRF发生突变,产生第三个短链nsp2,又称“nsp2N”。另外,我们还发现: −2和 −1 PRF都是由某个蛋白因子反式激活的,尤其是PRRSV 复制酶亚单位(nsp1β)。我们发现在nsp1β结构域插入基因后其有一高度保守区,那么可以推定结合RNA的目的是强化PRF的反式激活。根据PRF的要求将RNA序列缩短在34-nt范围内(序列包括光滑序列和下游的保守序列CCCANCUCC)。用pull-down 方法分析nsp1β和PRF信号相互作用。
这项研究首次证实:nsp2TF蛋白可以作为核糖体移码的反式激活因子。最新发现的移码决定因素为动脉炎病毒疾病防控提供了可能的抗病毒方向。而且,诱导蛋白反式激活移码是一种被广泛使用的机制,可能适用于之前未被发现的通过调控基因表达或调节宿主细胞翻译后感染病毒的途径。
Yanhua Li, Emmely E. Treffers, Sawsan Napthine, Ali Tas, Longchao Zhu, Zhi Sun, Susanne Bell, Brian L. Mark, Peter A. van Veelen, Martijn J. van Hemert, Andrew E. Firth, Ian Brierley, Eric J. Snijder and Ying Fang.Transactivation of programmed ribosomal frameshifting by a viral protein. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. doi: 10.1073/pnas.1321930111