猪的存活率是一个具有相关社会福利影响的重要经济性状,因此是当前养猪系统的一个重要选择标准。我们旨在估计杂交猪群在不同生产阶段的存活率(协)方差分量,并通过单步基因组最佳线性无偏预测(ssGBLUP)研究包含基因组信息的益处,并就存活性状的预测准确率与传统BLUP结果相比。在两个多性状阈值模型下评估了最多64894头杂交仔猪的个体存活记录。第一个模型包括分娩、哺乳和断奶后存活率,而第二个模型包括保育期和育成期存活。使用BLUP和ssGBLUP方法估算直接育种值和母系育种值。此外,使用线性回归验证方法评估预测精度、偏差和离散度。
在所有研究阶段对存活率的直接遗传力估计值都较低(从0.02到0.08)。断奶前阶段(分娩期和哺乳期)的存活率由母猪和仔猪的加性遗传效应控制,尽管母猪方面更为重要。与断奶前阶段相比,断奶后阶段(保育期、育肥期以及两者的结合)显示出相同或更高的直接遗传力。断奶前和断奶后阶段的存活性状之间的遗传相关性良好且较强,但断奶前和断奶后阶段之间的相关性中等。存活性状的预测精度较低,尽管与BLUP相比,通过ssGBLUP包含基因组信息提高了预测精度。BLUP的直接育种值和母系育种值同样准确,但直接育种值更多地受益于基因组信息。总的来说,当包含基因组信息时,观察到的偏差略有增加,而育种值的离散度则大大降低。
断奶后整体存活率比断奶前阶段表现出更高的直接遗传力,并且在所有评估的生产阶段中预测精度最高,因此作为提高存活率的候选性状脱颖而出。存活率是一个复杂的性状,遗传力低;然而,仍然可以获得重要的遗传增益,特别是在基因组预测框架下。
来源:Leite NG, Knol EF, Seccatto Garcia AL, Lopes MS, Zak L, Tsuruta S, Fonseca e Silva F, Lourenco D. Investigating pig survival in different production phases using genomic models. Journal of Animal Science. 2021; 99(8): skab217. https://doi.org/10.1093/jas/skab217