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巴塞罗那自治大学的CReSA部门的研究员，国家兽医研究所（丹麦科技大学），皮尔布赖特研究所（英国）和CIAD（墨西哥）对全基因序列进行了研究，以确定病毒基因组的潜在重组断点。对于为了ORF5基因，分别分析了来自于不同地区的11组基因型1（包括2株亚洲型，1株美国型和7株欧洲型），和3组来自于中国，墨西哥和美国的基因型2序列。
在10株基因型1中（共11株）检测到潜在的重组断点，在其中9株中，至少有一株基因在断点前后基因群不同。对基因型2型，在3株中的2株，至少有一株在在断点前后有3个基因群不同。实验结果表明大部分ORF5基因含有至少一个重组序列。当对1型和2型全序列进行分析时，发现其分别含有10和9个断点，导致了断点前后拓扑结构的显著差异。在基因1型序列中检测到嵌合基因组。
蓝耳病毒是世界范围内影响生猪生产的最重要的病毒之一，并造成严重的经济损失和公共卫生问题。关于蓝耳病毒的一个关键问题源于其基因多样性，其被认为直接影响免疫生物学，流行病学，诊断和疫苗效果。造成这种基因多样性的一个原因是不同病毒株之间的重组。此研究证明在大多数生猪主产国普遍存在蓝耳病病毒重组株，特别是蓝耳病毒基因1型。此结果对蓝耳病毒株的特有特性，进一步的系统发育研究，和对蓝耳病病毒控制措施的发展有一定的启示。此外，此研究强调深入了解蓝耳病毒基因多样性产生的机制和情况是至关重要的。
Martín-Valls GE, Kvisgaard LK, Tello M, Darwich L, Cortey M, Burgara-Estrella AJ, Hernández J, Larsen LE, Mateu E. Analysis of ORF5 and Full-Length Genome Sequences of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Isolates of Genotypes 1 and 2 Retrieved Worldwide Provides Evidence that Recombination Is a Common Phenomenon and May Produce Mosaic Isolates. J Virol. 2014 Mar;88(6):3170-81.