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非洲猪瘟病毒转录组

一项全基因转录组研究,为ASFV的转录提供了独特的见解,并可作为辅助未来功能分析的资源。

10 4月 2020
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非洲猪瘟病毒(ASFV)可引起猪的出血热,是有史以来对全球畜牧业威胁最大的疾病。尽管如此,对其转录调控机制的研究却很少。利用RNA测序方法,我们测定了总RNA丰度、转录起始位点和转录终止位点。这使我们能够表征早期和晚期ASFV核心启动子的DNA共有基序,以及决定转录终止的聚胸苷酸序列决定簇。

我们的结果表明,ASFV在感染的早期和晚期间利用了替代的转录起始位点,且ASFV-RNAP在转录单位的5'末端经历了启动子近端的转录滑动,向mRNA上添加了模板化的AU-和AUAU-5'延伸。

本文我们介绍了第一个急需研究的项目-全基因转录组,该研究提供了对ASFV转录的独特见解,并为将来对ASFV基因的功能分析提供了资源,而这对于对抗这种毁灭性疾病至关重要。

来源: Cackett, G., Matelska, D., Sýkora, M., et. al. The African Swine Fever Virus Transcriptome. Journal of Virology (2020). doi: 10.1128/jvi.00119-20

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