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微生物在动物胃肠道中的重要性被认为是宿主健康的关键因素。近年来，人们已经认识到了真菌群的重要性，但独立培养的研究还很有限，尤其是在猪上。断奶是一个产生应激、日粮变化和易感疾病的时期，其是猪场生产的关键点。在这项初步研究中，我们试图评估和表征从出生到断奶仔猪粪便中的真菌群落，以研究仔猪粪便中的真菌群落数量及其时间的动态变化。
培养的粪便样品表明，断奶后真菌的数量显着增加，与成年动物水平没有差异，表明定殖稳定。在所有测试的环境样品中均未发现可培养的真菌，包括水，食物，母乳或初乳。为了确定目前存在的真菌多样性并解决不可培养的真菌问题，我们进行了初步研究，利用ITS和16S rRNA引物分别对真菌和细菌进行高通量测序。细菌种群的多样性在实验期间增加（出生后1-35天），但真菌种群并未表现出相同的趋势。断奶后，粪便中的菌群有一个动态的变化，以酵母菌为主。真菌群的变化是由于活性干酵母（kazachstaniaslooffiae）所致，其是一种特征性较差的动物胃肠道定殖菌。
本研究为仔猪断奶过渡期真菌的早期定殖和后续建立提供了基础。未来的研究将探讨在断奶过渡期间，真菌群对仔猪生长和健康的影响。
Summers KL, Frey JF, Ramsay TG, Arfken AM. 断奶过渡期仔猪真菌群的初步研究。 J Anim Sci. 2019 May. https://doi.org/10.1093/jas/skz182
来源： Summers KL, Frey JF, Ramsay TG, Arfken AM. The piglet mycobiome during the weaning transition: a pilot study. J Anim Sci. 2019 May. https://doi.org/10.1093/jas/skz182