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通常在断奶或育成阶段可见猪沙门氏菌病，其可能导致临床疾病或成为带菌状态。在带菌状态下，沙门氏菌可通过粪便间歇性排毒，由于潜在的猪肉污染而造成公共健康问题。准确和及时地检测沙门氏菌对实施适当的治疗方案和预防策略至关重要。兽医们通常质疑哪类样本最适合沙门氏菌的猪群水平监测。目前广泛使用口腔液体检测蓝耳病毒和猪流感病毒，收集起来快速而便宜。虽然鞋上的赃物也很容易收集，但目前在猪业中并不常用于监测病原体。粪便样本是检测猪业中许多病毒和细菌的最常用样本，但收集起来比前两种样本更耗时。本研究旨在实验攻毒沙门氏菌各种血清型，比较口腔液体和鞋上赃物与现行粪便采样的黄金标准鉴定沙门氏菌的准确性。
使用从提交给爱荷华州立大学兽医诊断实验室的临床样品种获得的分离物，通过口服灌胃和扁桃体拭子，用109CFU的沙门氏菌实验性感染5周龄猪。20头猪感染鼠伤寒沙门氏菌，20头猪感染沙门氏菌I 4，[5]，12：1： - （2个独立的组，共5个猪栏，每个猪栏4头猪）。直到接种后7天（PI），每天检测所有猪的直肠温度，在剩余的3周时间，每两周检测一次。在接种后第2，4，7，14，21和28天采集样品。每次穿过猪栏后采集鞋上的赃物样本，在每个感染血清型的所有猪栏中穿同一双短靴。在每个猪栏中悬挂绳索收集口腔液体30-60分钟。通过数字直肠触诊收集每头猪的粪便样品。在收集样品后，沙门氏菌定量前，储存在-80°C。使用木糖 - 赖氨酸 - Tergitol-4（XLT4）琼脂的标准平板计数方法完成沙门氏菌定量。所有样品在缓冲的蛋白胨水中富集18-24小时，然后接种在亮绿（BG）琼脂和XLT4琼脂上。使用MAL-DI-TOF-MS确认每个沙门氏菌特征样品的子菌落，在XLT4琼脂上为黑色，在BG琼脂上为红色，证实为沙门氏菌。
接种后第2天，猪的中位温度达到峰值39.3ºC，并在接种后第5天回归到基准水平38.5ºC。接种后第2天，粪便中平均沙门氏菌含量达到峰值8.04×10 4 CFU / mL。在接种后第28天的富集后粪便中仍可检测到沙门氏菌。口腔液体的平均沙门氏菌数量在接种后第3天达到峰值，为5.6×102CFU / mL。从接种后第7天开始，在口腔液体中不能检测到沙门氏菌。在整个测试期间，鞋上赃物仅有零星的阳性，检测到的平均沙门氏菌最高水平出现在接种后第4天，仅为100CFU / mL。仅在接种后4天内能检测到沙门氏菌。选择最合适的样本类型对于正确监测病原体非常重要。鉴于鞋上赃物的沙门氏菌阳性不能反映疾病水平，且并不是一直为阳性，故证明其不适合做检测沙门氏菌的样本类型。口腔液体是一种可接受的样品类型，但仅在沙门氏菌暴发急性期才是可接受的，此时沙门氏菌水平最高。建议对这些口腔液体液样品进行浓缩，以确保通过培养检测到足够的沙门氏菌。
虽然粪便样本收集起来耗时最长，但它应仍是检测沙门氏菌的黄金标准，因粪便样本最能通过直肠温度反映疾病水平，此外在感染后，可在最长时间内检测到最高水平的沙门氏菌。
S. Naberhaus, A. Krull, B. Arruda, P. Arruda, D. Magstadt, F. Matias Ferreyra, Honorato Gatto, H. Meiroz de Souza Almeida, A. Kreuder. Comparison of pathogenic Salmonella spp. detection from porcine oral fluids, over-the-shoe booties, and fecal samples. 49 th Annual Meeting of the American Association of Swine Veterinarians (March 3-6, 2018)
