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自2017年2月以来，中国南部的某一传染性胃肠炎病毒（TGEV），猪流行性腹泻病毒（PEDV）和猪丁型冠状病毒（PDCoV）阴性的养猪场出现新生仔猪的腹泻疫情。通过病原体的分离和细胞培养，发现了新型猪肠道甲型冠状病毒（暂命名为SeACoV），其与十年前在该地区分离出的蝙蝠冠状病毒HKU2有关。使用在同一猪场收集的阳性母猪血清而非使用TGEV-，PEDV-或PDCoV-特异性抗体，在SeACoV感染的Vero细胞中检测到特异性荧光。电镜观察表明，表面突起的病毒颗粒直径为100-120nm。完整的基因组测序和SeACoV分析表明，SeACoV刺突（S）糖蛋白的氨基末端结构与α冠状病毒NL63的结构域0结构相似，而S蛋白的其余部分在结构上类似于B型冠状病毒的结构域B至D。与肠嗜性相关的SeACoV-S结构域0具有非常高的变异性，该区域有75个氨基酸点突变及2个氨基酸的插入，与HKU2相比，其有跨种传播的可能。
将分离的病毒经口接种3日龄的新生仔猪，可见感染仔猪出现腹泻和粪便病毒脱落的临床症状。
结果表明，新型猪肠道冠状病毒是发现的第五种猪冠状病毒。
Yongfei Pan, Xiaoyan Tian, Pan Qin, Bin Wang, Pengwei Zhao, Yong-Le Yang, Lianxiang Wang, Dongdong Wang, Yanhua Song, Xiangbin Zhang, Yao-Wei Huang. Discovery of a novel swine enteric alphacoronavirus (SeACoV) in southern China. Veterinary Microbiology 211 (2017) 15–21. http://dx.doi.org/10.1016/j.vetmic.2017.09.020
