背景
蓝耳病病毒是造成越南猪业最主要经济损失的病原体。ORF5基因参与多种作用过程,包括病毒的组装,病毒进入宿主细胞,和病毒对宿主免疫应答的适应,其已被广泛应用于分子演化和系统发生学研究。了解蓝耳病病毒地方流行株的分子演化可能有助于越南对蓝耳病的控制。
结果
系统进化分析表明所有的毒株均属于8.7和5.1亚系。毒株之间核苷酸和氨基酸的一致性分别为84.5–100% 和82–100%。此外,实验结果揭示了2个亚系核苷酸和氨基酸的一致性存在不同。n-糖基化表明7种可能的n-糖基化位点和11个糖型。分析GP5 序列可见7个正性选择压力位点和25个负性选择压力位点。
结论
基于ORF5序列的系统进化分析揭示了越南蓝耳病病毒的多样性。此外,揭示了n-糖基化位点和其在选择压力下位置的不同。本研究扩展了对蓝耳病病毒在越南的遗传多样性和演化的现有了解,并有助有蓝耳病病毒疫苗在越南的研发。
Hai Quynh Do, Dinh Thau Trinh, Thi Lan Nguyen, Thi Thu Hang Vu, Duc Duong Than, Thi Van Lo, Minjoo Yeom, Daesub Song, SeEun Choe, Dong-Jun An and Van Phan Le. Molecular evolution of type 2 porcine reproductive and respiratory syndrome viruses circulating in Vietnam from 2007 to 2015. BMC Veterinary Research 2016 12:256. DOI:10.1186/s12917-016-0885-3