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肠道沙门氏菌是造成食源性疾病的主要原因。近期研究表明肠道沙门氏菌是一种可造成肠道菌群组成改变的病原体。近期的一项前瞻性研究（法国猪场）发现肠道沙门氏菌和胞内劳森氏菌之间存在统计上显著相关。
本研究对比了鼠伤寒沙门氏菌和或胞内劳森氏菌攻毒猪和未攻毒猪的肠道微生物组成。主分量分析表明攻毒任一病毒可破坏结肠和盲肠肠道菌群组成。攻毒猪间的微生物组成相似，但与未攻毒猪的菌群组成不同。攻毒猪的厌氧杆菌，片球菌，普氏菌属，假丁酸弧菌属呈统计学显著增加。为了确定此种改变是否为实验攻毒猪所特有，我们确定了自然感染肠道沙门氏菌猪的粪便微生物组成。与不排毒或偶尔排毒的猪相比，经常排毒猪的粪便微生物组成类似。
对比自然感染和实验室感染猪的细菌显示，9个属的细菌显著不同，且每一个都在2组之间表现出显著的增加或降低。故不论实验室感染或人工感染肠道沙门氏菌，猪的肠道菌群组成的变化相似。
Klaudyna A. Borewicz , Hyeun Bum Kim , Randall S. Singer, Connie J. Gebhart, Srinand Sreevatsan, Timothy Johnson, Richard E. Isaacson. Changes in the Porcine Intestinal Microbiome in Response to Infection with Salmonella enterica and Lawsonia intracellularis. PLOS One. October 13, 2015.
Doi:10.1371/journal.pone.0139106