本文报道了美国猪流行性腹泻(PED)的疫情,并且根据PED发生的时间和空间证据,对该病毒(PEDV)的起源、进化、基因分型进行了研究。该研究对病猪的小肠切片进行了组织学病变分析,并对明尼苏达州和爱荷华州分离出的三个PEDV毒株进行了完整基因组测序。
对三个分离株的遗传学和系统进化分析表明,他们与中国PEDV毒株关系密切,推测很可能来源于中国。美国PEDV毒株进化时发生进化趋异,分化成两个亚系。这三个分离株与2012年中国安徽省分离的毒株关系最近,这可能是不同病毒系或亚系发生多重重组的缘故。根据完整基因组测序结果,对分化时间进行的分子钟分析结果与实际发生时间一致,即中美两国PED爆发时差大概是2到3年,两国PED爆发时间分别是2010年12月和2013年5月。研究发现美国PEDV新毒株与一种蝙蝠冠状病毒在5′非翻译区有一些共同的遗传特征,这进一步支持了PEDV从蝙蝠进化而来,具有跨物种传播的潜力。
该研究结果对于理解美国现在爆发的PEDV具有重要意义,为未来PEDV的有效防控提供了指导方向。
Yao-Wei Huang, Allan W. Dickerman, Pablo Piñeyro, Long Li, Li Fang, Ross Kiehne, Tanja Opriessnig, Xiang-Jin Meng. Origin, Evolution, and Genotyping of Emergent Porcine Epidemic Diarrhea Virus Strains in the United States. mBio vol. 4 no. 5 e00737-13. http://mbio.asm.org/content/4/5/e00737-13