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虽然口蹄疫引起的死亡率不高，但发病率却非常高，每年给全球养猪业造成了巨大的经济损失。这种经济损失可以分成两类：（1）生产下降和猪群结构改变导致的直接损失；（2）FMD防控成本和贸易受限造成的间接损失。
单从生产下降和免疫成本来看，口蹄疫每年给疫区造成的经济损失在65-210亿美元之间。此外，无FMD国家和地区如果爆发口蹄疫，每年造成经济损失将达15亿/年。
FMD造成的经济损失因地而异：:
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FMD造成的生产下降对世界最贫穷国家影响最大，因为在那里更多的人依赖家畜。FMD降低了家畜的繁殖能力，导致生产效率下降，限制了易感FMD却高产的种猪品种的推广。总之，口蹄疫造成的生产方面的直接损失降低了家畜的生产效率，影响了食品安全。
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FMD防控需要很高的成本，由于担心FMD再次爆发，因此无法终止防控项目。
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FMD流行国家甚至受威胁国家，很难进入国际市场进行贸易活动。
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如果无FMD国家爆发该病，再次获得无FMD国家资格需要大量的资金投入。
FMD传染性很强，一个猪场的防控水平将直接影响另一猪场是否爆发FMD。因此FMD的防控需要国家内部和国家之间的协调。FMD防控需要大量公共资源，因此国家和国际投资必不可少。
提高贫穷国家FMD防控水平，需要这个国家兽医服务水平的长期发展。改善的兽医水平可以为国家带来更多的利益，包括控制其他疾病。
T.J.D. Knight-Jones, J. Rushton; The economic impacts of foot and mouth disease – What are they, how big are they and where do they occur?; Preventive Veterinary Medicine, Available online 16 August 2013 http://dx.doi.org/10.1016/j.prevetmed.2013.07.013