目前在全球范围内流行的PRRS基因型有两种:欧洲 I型和北美II型。PRRSV 3’端有一个编码结构蛋白15kb的基因组。
2013年,美国俄亥俄州的六头猪患有严重的呼吸道疾病。采集其血样,送至美国俄亥俄州农学院的动物疾病诊断实验室检测。实时RT-PCR分析所有样品发现PRRSV为阳性。样品的CT值为15.85-28.38。用MARC-145细胞系分离病毒。接种病毒后4天观察细胞病理反应。最后对整个样品进行测序。结果显示PRRSV毒株 (OH28372)与GenBank上公布的序列(包括XW001 和NADC30)相似度为92%或更低。OH28372毒株的ORF5基因序列与GenBank上的核酸序列相似度为96%。OH28372 3’端的非编码区缺失了13个核苷酸。与基因组分析一致,多基因系统研究表明:OH28372与目前的北美株更相似(XW001 and NADC30)。
本研究主要强调了使用基因组测序持续监控PRRSV的重要性。
L. Wang, Y. Zhang. Genomic sequencing and analysis of a new porcine reproductive and respiratory syndrome virus isolate from Ohio: virus continues change. 2014 North American PRRS Symposium.