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本研究的目的是建立复合实时荧光定量RT方法，检测猪腹泻猪粪便样本中猪细环病毒1型和2型以及猪星状病毒4型和5型的感染率。
88个腹泻粪便样本来自爱荷华州兽医诊断实验室2011年送检。所有的样本均来自不同的猪场，采集自各个年龄阶段的腹泻病猪。13个样本来自哺乳仔猪，39个样本来自保育猪，16个样本来自生长育肥猪，19个样本的猪年龄不详。为了检测和区分5型猪星状病毒，我们建立了复合实时荧光定量RT-PCR方法。
星状病毒4型的感染率（53.4%）最高，其次分别是猪细环病毒2型（48.9%）、猪细环病毒1型（31.8%）、猪星状病毒5型（4.5%）。81.2%（13/16）的生长育肥猪样本、23.1%（9/23）保育猪样本、7.7%（1/13）哺乳仔猪样本中发现了星状病毒4型和猪细环病毒1型混合感染。
该研究结果表明，在美国，猪腹泻粪便样本中的猪细环病毒1型和猪星状病毒4型感染率高。与哺乳仔猪和保育猪相比，生长育肥猪的星状病毒4型和猪细环病毒1型混合感染率最高。本研究结果的临床指导意义还不明确。可能是这两种病原导致腹泻，这两种病原可能是通过肠道途径传播，在粪便中发现这两种病原是偶然的。未来的研究应该集中在检测更多病猪和健康猪的样本，进行攻毒感染试验。
Prevalence of porcine astrovirus and Torque teno sus virus in fecal samples from pigs with diarrhea collected in the United States. T Opriessnig, CT Xiao, PG Halbur. IIPVS, 2012.